Баткенский государственный университет проходит процесс программной аккредитации, проводимой Агентством по аккредитации образовательных программ и организаций.

Аккредитационная комиссия всесторонне проверяет материально-техническую базу вуза, проводит фокус-групповые интервью со студентами, выпускниками, родителями, преподавателями, социальными партнёрами, работодателями и руководством. Эти интервью направлены на получение подробной информации о деятельности университета.

Аккредитация продлится два дня, по итогам которой будет дана оценка качеству образовательных программ.